Apuntes sobre R y Rstudio

¿Qué es R y qué es RStudio?

R es un lenguaje de programación enfocado en el análisis de datos y estadísticas.
RStudio es un entorno de desarrollo integrado (IDE) que facilita el trabajo con R y permite organiza los proyectos y facilita la ejecución de código, la visualización de gráficos y la gestión de paquetes.

Partes de RStudio

RStudio tiene cuatro paneles principales:

Console: Donde se ejecuta el código en tiempo real.
Editor de scripts: Para escribir y guardar código en archivos .r, .R o .Rmd.
Environment/History: Muestra variables y comandos previos.
Files/Plots/Packages/Help: Para manejar archivos, visualizar gráficos, instalar programas y acceder a documentación.

Creación de un Proyecto en RStudio

Beneficios de trabajar con proyectos:

Organización de archivos y código.
Facilita la reproducibilidad.
Evita problemas con rutas de archivos.

Para crear un proyecto:

En RStudio, ir a File > New Project.
Elegir un directorio nuevo o existente.
Trabajar siempre dentro del proyecto para evitar problemas de rutas.

Organización de Proyectos en RStudio

Mantener una estructura organizada en los proyectos es clave para la reproducibilidad y eficiencia. Se recomienda la siguiente estructura de carpetas:

proyecto/
│── data/         # Datos crudos y procesados
│── scripts/      # Código fuente en R
│── output/       # Resultados y gráficos
│── reports/      # Documentación y reportes
│── README.md     # Descripción del proyecto

Además, para lograr una nomenclatura eficiente y consistente en archivos, se pueden seguir algunas pautas:

Consistencia: Usar un esquema de nombres consistente en todo el proyecto.
Evitar Espacios: Usar guiones bajos (_) o guiones (-) en lugar de espacios.
Prefijos y Sufijos: Usar prefijos y sufijos estandarizados para identificar el estado o versión del archivo.
Evitar Acentos y Caracteres Especiales: No utilizar acentos, eñes ni caracteres especiales que puedan causar problemas de compatibilidad en diferentes sistemas operativos o herramientas de software.

Ejemplos:

bears_cytb.nex
tree_BD.Rev
multifig.R
qw_feature2.csv

Rutas Absolutas y Relativas

Las rutas de archivos en R pueden ser absolutas o relativas:

Ruta absoluta: Define la ubicación exacta de un archivo, por ejemplo:
```
read.csv("C:/Users/TuUsuario/Documents/data/datos.csv")
```
Ruta relativa: Se basa en la ubicación del proyecto:
```
read.csv("data/datos.csv")
```

Siempre es recomendable usar proyectos para evitar errores con rutas.

Principales Objetos en R

Vectores

x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
print(x)

Matrices

m <- matrix(1:9, nrow=3)
print(m)

Data Frames

df <- data.frame(Nombre=c("A", "B", "C"), Edad=c(25, 30, 22))
print(df)

Listas

lista <- list(Nombre="Juan", Edad=30, Notas=c(8, 9, 10))
print(lista)

Asignación de Variables

Diferencia entre <- y =:

a <- 10   # Recomendado para asignaciones
b = 20    # También funciona, pero es mejor evitarlo

Uso de Funciones en R

Ejemplo de funciones básicas:

numeros <- c(1, 2, 3, 4, 5)
mean(numeros)  # Media
summary(numeros)  # Resumen estadístico

Instalación y Uso de Paquetes

install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
help(ggplot2)  # Consultar documentación

Acceder a los archivos de Ubuntu en RStudio

Ejecuta el siguiente comando en PowerShell:
```
wsl.exe wslpath -w ~
```
Mostrará una dirección como la que se muestra:
```
\\wsl.localhost\Ubuntu\home\tu_usuario
```
En RStudio puedes establecer el directorio de trabajo en la carpeta de Ubuntu (WSL) usando setwd(). Ten cuidado en las diuagonales, en powershell las diagonales son invertidas * y cuando las utilices en R utiliza las diagonales normales /*:
```
setwd("//wsl.localhost/Ubuntu/home/tu_usuario/mi_proyecto")
```