Introducción a la programación para bioinformática con bash

Sobre este curso

Introducción a la programación para bioinformática con Bash es un curso del Posgrado en Ciencias Biológicas (UNAM) enfocado en aprender a usar la terminal como herramienta de trabajo para bioinformática. La meta no es memorizar una lista infinita de programas, sino entender la lógica de la línea de comandos y desarrollar habilidades para moverte con soltura en Linux, trabajar en servidores, y construir flujos de trabajo ordenados, reproducibles y escalables.

Durante el semestre practicaremos desde lo básico (navegar por el sistema, permisos, manejo de archivos) hasta tareas más “bioinformáticas” (organización de proyectos, manipulación de archivos de secuencias, automatización con scripts, y ejecución/monitoreo de procesos). El curso será presencial y en línea, con actividades prácticas guiadas y ejercicios para consolidar lo aprendido.

Nota: este sitio y el temario marcan la ruta general. Algunos ejemplos, herramientas y énfasis podrán ajustarse durante el curso según el ritmo del grupo y los intereses del proyecto final.

Instructores

M. en I. Mauricio Morgado — Técnico Académico Asociado C en la Unidad de Informática para la Biodiversidad (UNIBIO). Su experiencia se centra en ingeniería y desarrollo de software, administración de redes y servidores y seguridad informática, con aplicación directa a proyectos de informática para la biodiversidad y manejo de datos.
Dr. Cristian Cervantes — Técnico Académico Asociado C en la Unidad de Síntesis en Sistemática y Evolución (UniSSE). Trabaja en bioinformática, taxonomía y sistemática, con énfasis en análisis de datos genómicos y apoyo metodológico para proyectos evolutivos.

Temario

Introducción a la programación para bioinformática con bash

Unidades

(Iremos agregando el resto de unidades conforme avancemos en el semestre.)